После первых исследований комплекса, появилось множество гипотез о его строительстве и назначении. Возникали и невероятные: о помощи пришельцев или о тайных могуществах и знаниях кхмеров. На необыкновенные способности кхмерских крестьян полагаться не приходится, уровень культуры в Х-ХШ вв. весьма сомнителен. Джаяварман VII в хозяйственной деятельности использовал многие знания, опыт и умения индийских мастеров, однако возведение храма было начато задолго до него, а замысел Ангкор Вата и «генплан» были едины. Город с постройками высотой с 25-этажный дом, площадью в несколько десятков квадратных километров соорудили крестьяне-аграрии? Маловероятно.

То есть, разумеется, все черновые и отделочные работы, в том числе искусную резку по камню, они могли произвести. А кто руководил работой тысячи резчиков? Кто придумал сей грандиозный план? Скорее всего, не обошлось без индуистских или тибетских астрономов-астрологов, ибо такими знаниями небесной механики в то время мало кто обладал. Отсюда напрашивается версия, что Ангкор Ват не столько храм, сколько обсерватория. На одной из стел в королевском зале высечена надпись: «Страна Камбу есть отражение неба», а храмы комплекса, если посмотреть на них из космоса и прочертить между ними невидимые линии, образуют собой практически точную «копию» созвездия Дракона.

Для чего была нужна кхмерам такая обсерватория? Местный фольклор богат песнями и поэмами о неком Небесном принце, в честь которого и был построен Ангкор. Принц помогал в строительстве главного храма и в награду за его возведение обещал королю взять его с собой. Исследование архитектуры не дало ответов. Более того - породило новые вопросы, в том числе касающиеся «египетской загадки»: каким образом многотонные блоки поднимались и устанавливались на такие высоты? Как аграрии, выращивающие рис и незнакомые даже с примитивными ирригационными системами, могли с ювелирной точностью укладывать огромные «кирпичи», не используя строительных растворов? В строительстве иных кхмерских городов подобные ноу-хау не использовались. Очевидно, строительству Ангкор Вата придавалось огромное значение.